يهدف مركز الأبحاث لإنشاء بيئة مؤاتية للبحث العلمي تمكن المركز الأقليمي لتطوير البرمجيات التعليمية ليصبح مركز بحث علمي بارز على المستوى الإقليمي، فضلا عن القيادة الدولية في مجال التعلم الإلكتروني والاستفادة من البحوث.
كما يهدف مركز الأبحاث للقيادة في مجال بحوث التعلم الإلكتروني والتنمية التعليمية. يلتزم مركز الأبحاث بإجراء ونشر البحوث التطبيقية، والبحوث الأساسية. ومن خدمات المركز المهمة توفير المعرفة المتخصصة لتصميم أفضل لبرامج التعليم الإلكتروني للمجتمع العربي. ويشمل هذا الالتزام بتحديد المشاكل الجديدة و المتطورة وكذلك توفير الوقت والجهد اللازم لمعالجة المشاكل القائمة. يشجع المركز على البحث العلمي في تطوير التعلم الإلكتروني العربي للمتعلمين الأصحاء و ذوي الإحتياجات الخاصة. والهدف من هذه الأبحاث هو وضع المبادئ التوجيهية المستخدمة في تصميم وبناء برامج تعليمية سهلة الإستخدام. كما يقوم المركز بتقديم المشورة للمؤسسات والمراكز فيما يختص بتصميم وبناء البوابات التعليمية الإلكترونية.